بعضی افراد همزمان با شروع رژیم کتوژنیک دچار عوارضی مانند حالت تهوع و استفراغ، خستگی شدید، بی‌حالی و مشکلات گوارشی می‌شوند. متخصصان به این علائم «کتوفلو» (علائم شبه‌آنفلوآنزای ناشی از رژیم کتوژنیک) می‌گویند. متخصصان تغذیه معتقدند که تقریبا 25 درصد افراد با شروع رژیم کتوژنیک دچار این علائم می‌شوند. معمولا این علائم به دلیل افزایش مصرف چربی‌ها و تبدیل‌سازی قند به انرژی در بدن اتفاق می‌افتند.